Adıyaman Üniversitesi Matematik Bölümü, İnönü Üniversitesi Adıyaman Fen-Edebiyat Fakültesine bağlı olarak 1998 yılında kurulmuş ve 1999 -2000 eğitim ve öğretim yılında öğrenci kabulüne başlamıştır. 2006 yılında Adıyaman Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesine bağlanmıştır.